Prototype 2 transcurre en la ciudad de Nueva York, 14 meses después de los hechos ocurridos en el primer Prototype; la ciudad se encuentra dividida en tres regiones, cada una afectada en menor o mayor medida por el virus Blacklight, las misiones que el Sargento James Heller habrá de cumplir, serán cada vez más difÃciles dependiendo de la zona en donde se encuentre. Sin mas que agregar los dejamos con el video.